SBIR·DOE 보조금은 스타트업의 과세 소득인가요?

SBIR 보조금이나 DOE 보조금은 법인의 과세 소득인가요?

과세 소득입니다. SBIR이나 STTR 지원금, 미국 에너지부(DOE) 보조금, 그 밖의 연방 연구 지원금은 받는 법인의 총소득입니다. "비희석(non-dilutive)"은 주식을 내주지 않았다는 뜻이지 비과세라는 뜻이 아닙니다. 회계 방식에 따라 돈을 인출하거나 그 돈으로 충당하는 비용이 발생할 때 과세되며, 지원 결정 통지서를 받을 때는 절대 과세되지 않습니다. 그 돈으로 낸 연구비는 여전히 공제됩니다. 미국 교육부를 포함해 어느 기관의 SBIR·STTR 지원금이든 세무상 결론은 같습니다.

• 정부 자금은 자본 출자가 아닙니다. 미국 법인은 자본 출자를 소득에서 제외하지만, 미국 세법은 이 용어에 정부 기관의 출자는 포함되지 않는다고 규정합니다(26 U.S.C. 118(b)(2)). 이 규정은 2017년 12월 22일 이후의 출자에 적용됩니다. 법인이 받은 보조금을 자본 출자라고 하는 예전 조언은 더 이상 맞지 않습니다.
• IRS(미국 국세청)의 일반 원칙. 주·지방 정부 보조금은 보통 과세 대상이며, 연방 보조금도 근거 법률이 달리 정하지 않는 한 보통 과세 대상입니다(Form 1099-G 작성 안내, 6번 칸). SBIR·STTR 법률에는 그런 제외 규정이 없습니다. 다른 프로그램의 금액을 비과세로 처리하기 전에 해당 법률의 문구를 확인하세요.
• 양식이 없어도 소득입니다. 기관은 일부 과세 보조금에 대해 Form 1099-G를 제출하며(6번 칸), 용역 계약 대금은 법인에 지급하더라도 Form 1099-NEC로 보고합니다(Form 1099-NEC 작성 안내). 양식을 받든 받지 않든 지원금은 소득입니다.

12월 31일을 넘기는 인출, 선급금, 장비, 캐나다 관계회사가 있으면 판단이 어려워집니다. 지원 협약서, 지급 조건, 날짜가 적힌 모든 인출 내역이나 청구서, 그 근거가 되는 원가 보고서를 준비하세요.

저희 SBIR 지원금은 보조금인가요, 계약인가요? 세금이 달라지나요?

둘 다 과세 대상입니다. 유형에 따라 Form 1120(미국 C corporation 소득세 신고서)에서 소득을 기재하는 줄, 적용되는 원가 규정, 장비 소유권이 달라집니다.

지원 협약 유형은 각 기관이 계약, 보조금, 협력 협약 중에서 정합니다(SBIR/STTR Policy Directive, 3(r) 및 7(g)). DOE는 SBIR·STTR 지원금을 자체 약관에 따라 보조금이나 협력 협약으로 지급합니다(DOE 일반 약관). 다른 기관은 확정 가격 계약이나 원가형 계약을 자주 씁니다. 유형은 지원 협약서에 적혀 있습니다.

Form 1120 작성 안내는 보조금을 어느 줄에도 명시하지 않으므로, 표는 일반적인 실무를 보여 줍니다. 기관은 SBIR·STTR 지원금에 합리적인 수수료나 이익을 지급해야 합니다(Policy Directive 7(g)(2)). 이 수수료도 소득입니다.

SBIR이나 보조금은 언제 과세되나요? 지원 결정 시, 인출 시, 지출 시?

지원 결정 시에는 절대 과세되지 않습니다. 지원 결정 통지서와 확정된 지원 금액은 소득이 아닙니다. 과세 연도는 회계 방식과 지원금의 지급 조건에 따라 정해집니다(Publication 538).

• 현금주의 방식. 소득은 받을 때, 또는 제한 없이 쓸 수 있게 되었을 때 과세됩니다. 돈에 대한 통제에 상당한 제한이 있으면 의제 수령(constructive receipt)이 아닙니다(Publication 538). 인정되는 비용에만 인출할 수 있는 확정 잔액은 기관 지급 시스템에 있다는 이유만으로 받은 것으로 보지 않는 것이 일반적입니다.
• 쓰기 전에 미리 받은 돈. SBIR 규정에서 선급금은 선택 사항입니다(Policy Directive 7(f)). 계약에 따른 선급금은 일반적으로 받을 때 소득이며, 발생주의 방식 회사는 아직 벌지 않은 부분을 미루는 선택을 할 수 있지만 다음 과세연도를 넘길 수는 없습니다(Publication 538). 쓰지 않으면 돌려줘야 하는 보조금 선급금에 대해서는 공표된 단일 규정이 없습니다. 과세 연도는 회계 방식과 지원 약관에 따라 정해지므로, 신고 전에 자문을 받으세요.

Phase I과 Phase II 기간은 12월 31일을 넘기는 경우가 많습니다. 소득은 지원 총액이 아니라 각 과세연도의 인출액이나 비용을 따라갑니다. 법인은 연평균 총수입이 $32,000,000 이하인 동안에만 현금주의 방식을 쓸 수 있습니다. 전환은 현금주의에서 발생주의로 전환하기를 참고하세요.

보조금으로 낸 연구비도 공제할 수 있나요?

공제할 수 있습니다. 보조금이 소득이므로 그 돈으로 낸 비용은 원래대로 처리됩니다. 미국 내에서 수행한 연구개발비는 section 174A에 따라 지급하거나 발생한 연도에 공제됩니다(Rev. Proc. 2025-28).

SBIR·STTR 작업은 기관이 일부의 해외 수행을 승인하지 않는 한 미국 안에서 해야 합니다(Policy Directive 6(a)(4)). 승인받은 해외 작업은 해외 연구비이며 15년에 걸쳐 상각합니다. 대학 같은 STTR 연구 파트너에게 지급한 금액은 회사를 위해 수행한 연구의 비용입니다. 미국 내 연구비를 대신 상각하는 선택과 해외 연구는 해외에서 수행한 소프트웨어 개발비 공제를 참고하세요.

지원받은 연구는 일반적으로 연방 연구 세액공제의 근거가 될 수 없습니다. 보조금, 계약 또는 정부 기관이 자금을 댄 연구는 제외되기 때문입니다(26 U.S.C. 41(d)(4)(H)).

기관이 비용을 대면 누구의 연구인가요?

IRS의 잠정 기준에 따르면, 스타트업이 결과물을 사용할 권리를 보유하는 경우 대개 스타트업의 연구입니다. 기관이 돈을 내더라도 비용은 스타트업의 것입니다. 이 기준은 연구 수행자가 연구 실패 시 재무적 위험을 지거나, 계약 수행을 넘어 결과물을 사용할 권리가 있으면 그 비용을 수행자 자신의 연구 비용으로 봅니다(Notice 2023-63 섹션 6, Notice 2024-12로 수정).

• 소기업은 연방 지원 협약에 따라 만든 발명의 소유권을 보유하는 선택을 할 수 있습니다(35 U.S.C. 202(a)). 다만 제한된 경우에 협약이 달리 정하면 그렇지 않습니다. 각 발명을 기관에 공개하고, 공개 후 두 해 안에 서면으로 선택해야 합니다. 특허 출원 제한 기한이 더 가까우면 그보다 빨리 해야 하며, 기관이 기간을 더 허용하면 예외입니다(35 U.S.C. 202(c)).
• SBIR·STTR 데이터 권리는 지원 시점부터 최소 20년 동안 회사의 데이터를 보호합니다(Policy Directive 3(hh)).

따라서 SBIR 자금으로 낸 비용은 보통 스타트업 자신의 연구비입니다. 지원 작업을 모두 미국에서 하고 연구비를 지급한 연도에 공제한다면 그해에는 이 구분이 아무것도 바꾸지 않습니다. 승인받은 해외 작업이 있거나 상각을 선택할 때 중요해집니다.

불확실한 점: Notice 2023-63과 Notice 2024-12는 이전 section 174 규정을 기준으로 작성되었습니다. Rev. Proc. 2025-28은 section 6을 section 174A로 옮기지 않았으며, 이 페이지를 확인한 시점에 두 section 모두 시행규칙안이 나오지 않았습니다.

지원금으로 산 장비는 누가 소유하고 감가상각하나요?

지원금 유형에 따라 다릅니다.

• DOE 보조금. 소유권은 장비의 사용·처분에 관한 지원 조건을 전제로 수혜자에게 귀속됩니다(2 CFR 910.360(b)). 보조금이 소득이었으므로 스타트업은 장비 원가 전액을 기준으로 감가상각합니다(Publication 946). 단가가 $5,000 이상인 장비는 지원 약관이 명시적으로 허용하지 않는 한 계약 담당관의 사전 서면 승인이 필요합니다(2 CFR 910.360(a)). 프로젝트에 더 이상 필요 없는 장비의 가치가 여전히 단가 $5,000 이상이면, 보유하려면 일반적으로 현재 가치 중 DOE 몫을 DOE에 내야 하고, 그렇지 않으면 DOE의 처분 지시를 따릅니다(2 CFR 910.360(g)).
• 원가 정산 계약. 직접비로 산 재산의 소유권은 공급업체가 인도할 때 정부로 넘어갑니다(FAR 52.245-1(e)(3)). 감가상각하려면 일반적으로 재산을 소유해야 하므로, 그 원가는 대신 계약 수행 비용이 됩니다.
• 확정 가격 계약. 계약업체는 일반적으로 계약을 위해 산 재산의 소유권을 보유하며, 납품 품목과 계약의 자금 조건이 달리 정한 경우는 예외입니다(FAR 52.245-1(e)(2)).

손실이 난 해에도 보조금 때문에 세금을 내야 하나요?

공제 가능한 비용이 지원금과 다른 소득의 합보다 크면 내지 않습니다. 이 경우 보조금은 지금 세금을 만드는 대신 이월되는 손실을 줄입니다. 대가는 나중에 옵니다. 이익이 난 해에는 이월 손실로 과세소득의 80%만 상쇄할 수 있습니다. C corporation의 과세 방식을 참고하세요. 발생주의 방식에서는 시점 차이로 어느 한 해에 과세소득이 생길 수도 있습니다.

주에서도 보조금에 과세하나요?

일반적으로 과세합니다. 많은 주가 연방 과세소득에서 출발하므로 보조금이 그대로 반영됩니다. 캘리포니아 주는 2025년 1월 1일 이후 시작하는 과세연도에 대해 연방 세법 준용 기준일을 그날로 옮겼으며, 법안 분석은 채택된 조항 중에 연방 자본 출자 규정 변경을 포함하고 있습니다(FTB 준용; SB 711 분석). 예전 버전의 미국 세법을 따르는 주는 확인하세요. SBIR 매칭 프로그램 같은 주 정부 보조금도 보통 연방 과세 대상입니다(Form 1099-G 작성 안내).

보조금이나 계약 지원금을 받으면 장부에 무엇을 기록해야 하나요?

지원금마다 별도 프로젝트로 관리하고, 입증할 수 있는 비용을 기록하세요. 연방 지원 수혜자는 각 지원금의 금액, 출처, 지출을 보여 주는 기록을 보관하고, 지출을 예산과 비교하며, 인정되는 비용을 판단하는 서면 절차를 갖춰야 합니다(2 CFR 200.302). DOE는 기업에 계약 원가 원칙을 따르게 합니다(2 CFR 910.352). 기관은 회사의 회계 시스템이 계약 원가를 산정하기에 적절할 때만 원가 정산 계약을 맺을 수 있습니다(FAR 16.301-3).

실무에서는 다음을 갖추세요.

• 지원금별 별도 프로젝트 또는 클래스
• 해당 프로젝트에 배정한 직접비와 별도로 모은 간접비
• 지원금에 시간을 청구하는 모든 사람의 근무시간 기록
• 인정되지 않는 비용은 별도 계정에 두고 모든 청구에서 제외(FAR 31.201-6)
• 장비 대장
• 연말 기준 보조금 미수금, 또는 지출 전에 받은 돈에 대한 이연 보조금 수익

장부상 매출 인식 시점은 세법상 시점과 다를 수 있으며, Form 1120의 Schedule M-1이나 M-3에서 둘을 조정합니다. 이런 체계를 갖추는 데 도움이 필요하면 장부 관리를, 장부를 누가 맡을지는 직접 장부 관리 또는 장부 담당자 고용을 참고하세요.

이 페이지에서 다루지 않는 내용: 보조금 신청서와 예산, 간접비율 제안서, 지원 전 회계 시스템 검토, 기관 감사, DOE 지출이 큰 수혜자에 대한 DOE 이행 감사, 연구 세액공제 청구, 데이터 권리, 수출 통제.

예시

이해를 돕기 위한 미국 달러 기준 예시입니다. 모두 역년 기준 C corporation입니다.

Phase I 보조금을 받고 손실이 난 액체 냉각 스타트업

콜드 플레이트와 냉각수 분배 장치를 만드는 보스턴의 스타트업이 $200,000 DOE SBIR Phase I 보조금을 받습니다. 보조금 프로젝트를 포함해 미국 엔지니어와 콜드 플레이트 시제품에 $1,400,000를 쓰고, 다른 소득은 없습니다. $200,000는 소득이고, $1,400,000는 section 174A에 따라 공제됩니다. 손실은 $1,400,000가 아니라 $1,200,000입니다. 지금 낼 세금은 없지만, 미래 이익을 상쇄할 손실이 $200,000 줄어듭니다.

연말을 넘겨 인출하는 전력 전자 스타트업

데이터센터 전력용 반도체 변압기를 만드는 오스틴의 스타트업이 비용 상환 방식으로 지급되는 $1,100,000 DOE SBIR Phase II 보조금을 받았습니다. 인정되는 프로젝트 비용 $500,000를 지급하고 $380,000를 인출했으며, 12월 비용분 $120,000는 1월에 들어옵니다.

• 현금주의 방식: 올해 $500,000 공제에 대응해 소득 $380,000, 다음 해에 소득 $120,000.
• 발생주의 방식: 일반적으로 올해 소득 $500,000.
• 장부: 12월 31일 기준 보조금 미수금 $120,000.

원가 가산 계약을 맺은 반도체 스타트업

광 인터커넥트 칩을 만드는 새너제이의 스타트업이 미국 국방부로부터 수수료 $100,000를 포함한 $1,700,000 원가 가산 확정 수수료(cost-plus-fixed-fee) SBIR Phase II 계약을 받았습니다. 올해 청구해 받은 $900,000는 1a번 줄의 총수입입니다. 계약 직접비로 산 $150,000 프로브 스테이션은 인도 시 정부 소유가 되므로 스타트업은 감가상각하지 않습니다. 같은 프로브 스테이션을 DOE 보조금으로 샀다면 지원 조건을 전제로 스타트업 소유가 되고, 스타트업이 감가상각합니다. 이 스타트업은 발명의 소유권을 보유하는 선택을 하므로, IRS의 잠정 기준에 따라 미국 내 연구비는 일반적으로 자신의 비용이며 올해 공제됩니다.

미국 지원금과 IRAP 같은 캐나다 지원은 어떻게 다른가요?

두 나라는 정부 지원금을 정반대로 다룹니다. 델라웨어 모회사 아래에 있는 캐나다 스타트업은 두 가지를 모두 받을 수 있습니다.

상황이 다르다면?

• 기관이 아니라 투자자나 창업자가 돈을 넣은 경우: 소득이 아니라 지분이나 대여금입니다. 해외에서 미국 법인에 자금 넣기를 참고하세요.
• SAFE나 컨버터블 노트로도 자금을 조달한 경우: SAFE와 컨버터블 노트를 참고하세요.
• 지원 작업 일부를 해외에서 하거나 상각을 원하는 경우: 해외에서 수행한 소프트웨어 개발비 공제를 참고하세요.
• 시제품, 테스트 보드, 툴링을 만드는 경우: 하드웨어 연구비와 시제품 비용 공제를 참고하세요.
• 이월 손실이 있거나 새 투자 라운드가 있는 경우: 손실 한도와 소유권 변경은 C corporation의 과세 방식에서 다룹니다.
• 총수입이 현금주의 방식 한도를 넘었거나 투자자가 발생주의 장부를 원하는 경우: 현금주의에서 발생주의로 전환하기를 참고하세요.
• 확정 가격 계약으로 연말을 넘겨 장비를 제작하는 경우: 맞춤 장비 장기 계약을 참고하세요.
• 워싱턴·오하이오·오리건 주에서 계약 연구를 수행하는 경우: 다른 주의 총수입세를 참고하세요.
• 캐나다 자회사나 모회사가 IRAP 등 정부 지원을 받는 경우: IRAP와 그 밖의 정부 지원금을 참고하세요.
• 선급 인출, 계약에 따른 장비, 두 나라의 지원금: 과세 연도와 처리 방법은 지원 약관에 따라 달라집니다. 데이터센터·하드웨어 스타트업 세무 서비스에서 도움을 받으세요.
• 지원금 관리에 맞는 장부가 필요한 경우: 장부 관리를 참고하세요.